长江有野生鳄鱼，为扬子鳄。扬子鳄是短吻鳄科短吻鳄属的一种鳄鱼。是中国特有的一种鳄鱼，是世界上最小的鳄鱼品种之一。因其生活在长江流域，故称“扬子鳄”。

在扬子鳄身上，至今还可以找到早先恐龙类爬行动物的许多特征。所以，人们称扬子鳄为“活化石”。因此，扬子鳄对于人们研究古代爬行动物的兴衰和研究古地质学和生物的进化，都有重要意义。中国已经把扬子鳄列为国家一级保护动物，严禁捕杀。