1、名称不同。芥菜在南方不同地区有不同的叫法，如大头菜、大菜、芽菜等。芥菜在北方有时则被称为芥菜或野菜。

2、做法不同。南方芥菜主要烹饪方法是食用芥菜叶子，比如腌制成酸菜用来炒肉或制作酸菜鱼。北方芥菜主要烹饪方法是食用芥菜的根部，其根部呈疙瘩状，腌制后可用来炒肉或做下饭咸菜。