东莞市的港口只有虎门港。东莞市下属的港口码头有沙田港区、立沙岛港区、新沙南作业区。码头较多，沙田港区的码头大部分是做集装箱的，立沙岛的码头是石化的，新沙南的赤湾港做杂货，海昌做煤。虎门港区是东莞最大的港口，位于珠江口太平水道东侧的虎门镇。